VisualVM

Provavelmenta a ferramenta que mais uso para analizar performance é a VisualVM.

Embora ela não seja tão bem acabada como o JProfiler, ela é OpenSource e gratuita, além de ter todas as ferramentas que costumo precisar, como:

• Monitoramento do número de threads
• Monitoramento de memória (heap e permgen)
• Monitoramento de cpu
• Possibilidade de extrair um Heap Dump
• Possibilidade de extrair um Thread Dump
• Analise detalhada de cada thread
• Sampling (profiler bem leve) de cpu e memória
• Profiling de cpu e memória

E ainda tem suporte à algumas dezenas de plugins.

Acho que a limitação mais chata dela é o Sampling de memória só funcionar local. Mas não é nada que eu tenha sentido muita falta até hoje.